医疗机构发生医疗事故的，由卫生行政部门根据医疗事故等级和情节，给予警告；情节严重的，责令限期停业整顿直至由原发证部门吊销执业许可证，对负有责任的医务人员依照刑法关于医疗事故罪的规定，依法追究刑事责任。
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关于医疗事故，如果涉嫌构成医疗事故罪的话是必须先经过医疗事故鉴定，由卫生局组织协调后才交由警方处理的。但是如果单纯的民事赔偿责任，是可以直接起诉的，具体是到门诊所在地的基层人民法院起诉，诉讼时效只有1年，注意及时起诉。
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医务人员在医疗活动中发生或者发现医疗事故，可能引起医疗事故的医疗过失行为或者发生医疗事故争议的，应当立即向所在科室负责人报告。